微生物質譜鑒定奶粉中的致病菌
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事件背景
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據新華社報道2022年2月22日報道,海關總署日前發布公告,提醒消費者“暫不通過任何渠道購買”以及“立即暫停食用”美國某公司旗下相關嬰幼兒產品。
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公告顯示,2月18日,美國食品和藥品監督管理局(FDA)宣布,正在調查四名嬰兒感染克羅諾桿菌和沙門氏菌事件的投訴。“所有與這些投訴有關的四例病例都住院治療了,其中一例可能因克羅諾桿菌導致了死亡。”四名嬰兒均食用了美國某公司在密歇根州斯特吉斯工廠生產的奶粉。
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該事件在網絡上一時引起渲染大波。
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認識克羅諾桿菌和沙門氏桿菌
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克羅諾桿菌屬(阪崎腸桿菌)因產生黃色素,最初被稱為“黃色陰溝腸桿菌”,1980年更名為“阪崎腸桿菌”,2008年擴大為克羅諾桿菌屬。其名字來源于希臘神話中的巨神克羅諾,傳說他的每個孩子一出生就被他一口吃掉,代表該菌對嬰幼兒的致病特性。該菌耐高滲透壓、抗干燥、對溫度的抗性比大多數革蘭氏陰性菌強,這是它不同于其他食源性致病菌的重要特征。據了解,克羅諾桿菌又名阪崎克羅諾桿菌,它可以引起發燒,喂養不良,過度哭泣或低能量以及其他嚴重的癥狀,甚至引起嚴重的侵入性感染和嬰兒早死。
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沙門氏菌是屬于腸桿菌科的一種細菌,是沙門氏菌病的病原體。沙門氏菌能引發多種疾病而且傳染能力較強,如蛋,家禽和肉類產品都是沙門氏君的傳染媒介。而且人食用攜帶沙門氏菌的人或帶菌者的糞便污染的食物可以使人發生食物中毒、腸胃炎。其中沙門氏菌引起的食物中毒最為普遍。這種細菌能能導致感染這種細菌的人和動物生病甚至死亡。據了解,沙門氏菌能引發多種疾病而且傳染能力較強,如蛋,家禽和肉類產品都是沙門氏君的傳染媒介。而且人食用攜帶沙門氏菌的人或帶菌者的糞便污染的食物可以使人發生食物中毒、腸胃炎。其中沙門氏菌引起的食物中毒最為普遍。這種細菌能能導致感染這種細菌的人和動物生病甚至死亡。
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奶粉中微生物檢測相關標準
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2010年3月,由衛健委(原衛生局)發布,我國現行檢驗標準GB4789.18-2010《食品安全標準——食品微生物學檢驗乳與乳制品檢驗》。
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2005年10月,由中國檢驗檢疫科學研究院和天津出入境檢驗檢疫局(天津海關)牽頭完成的《奶粉中阪崎腸桿菌檢測方法》行業標準實施,解決了中國檢測嬰幼兒配方奶粉中阪崎克羅諾桿菌無標準、無檢測方法的問題。
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2011年4月開始實施的國家標準《GB10765-2010 食品安全國家標準嬰兒配方食品》中,要求針對6個月以下的嬰兒配方奶粉進行抽樣時,每批次奶粉共抽檢3個樣品,每個樣品100克,不得檢出阪崎克羅諾桿菌。歐盟委員會和美國FDA相關標準要求是每批次抽檢30個樣品,每個樣品不超過10克,阪崎克羅諾桿菌不得檢出。
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微生物限量嬰兒配方食品國家標準及對微生物檢測的要求
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MALDI-TOF MS快速檢測微生物
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傳統的微生物鑒定方法有生化反應,基因測序,免疫學方法等,但耗時都比較長。基于MALDI-TOF的微生物鑒定系統,樣品培養好后幾分鐘即可出鑒定結果,比傳統方法更快捷,日常使用試劑耗材成本更低,通量更高。
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由融智生物自主研發的QuanID —— 新一代寬譜定量飛行時間質譜全自動臨床微生物質譜檢測系統,對MALDI-TOF MS革命性的改進,體現于對微生物鑒定的更高效率、更準確(重現性)以及更完整的微生物核糖體蛋白指紋圖譜庫。
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QuanID采用了微生物基因組學、蛋白組學和生物信息學相結合的獨特建庫方法,這種建庫方法對建庫的蛋白進行了針對性的選擇,數據更可靠,不受細菌培養條件影響。同時,支持數據庫升級,可檢克羅諾桿菌和沙門氏桿菌在內的包
括超過1800個菌屬,6600個菌種,覆蓋各類臨床常見微生物,獨有的二級數據庫,可有效區分基因型相似的難分辨菌。
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融智生物與某疾控中心合作,使用QuanID采集的質譜圖
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近年來,微生物質譜系統已廣泛應用在我國主要的醫療機構、疾病控制、高校科研以及出入境檢驗檢疫等領域。
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除了得益于超大的數據庫外,質譜硬件的性能也是鑒定準確性的保證。QuanID微生物質譜系統依托于融智生物新一代寬譜定量飛行時間質譜平臺QuanTOF(新一代的MALDI-TOF MS),檢測質量范圍更寬(10-1000,000Da),重現性更高(SD<5%),保證了微生物鑒定結果的高準確性。
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此外,QuanID微生物質譜系統的數據庫還有一個獨特之處,就是分為一級、二級兩個數據庫,二級菌庫涵蓋100多種相似病原體,可對基因型相近的難分辨微生物(如:大腸桿菌和志賀氏菌等)做出準確鑒定。
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MALDI-TOF MS鑒定細菌基本流程是,將細菌純培養后,點靶加釋放液,細菌經過釋放液充分處理后,可使得細胞內的蛋白成分更好地釋放出來,待溶劑揮發后加基質,蛋白分子與基質形成基質結晶,上質譜檢測。在質譜儀中,樣品通過有效的電離將不同質荷比(m/z)的離子分開形成細菌特異性的清晰的指紋圖譜,通過分析關鍵的質譜峰數據,與數據庫中的已知菌種譜圖進行比對,即可快速得到細菌鑒定結果。
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